净化工程中各级空气洁净度的空气净化处理，应采用一级、中、高效空气过滤器进行三级过滤。对于10万级空气净化处理，可以用亚高效空气过滤器代替高效空气过滤器。
空气过滤器的选择、布置和安装应符合以下要求:一次空气过滤器不应使用油浸式过滤器；中效空气过滤器应集中在净化空调系统的正压段；净化空调系统末端应设置高效空气过滤器或亚高效空气过滤器，高效空气过滤器的安装方式应简单可靠，并应进行检查和更换；应根据额定风量选择中效、次效和高效空气过滤器；同一净化车间应设置阻力和效率相近的高效空气过滤器。
在确定集中式或分散式净化空调系统时，应综合考虑生产工艺的特点和净化车间的空气洁净度水平、面积、位置等因素。生产过程连续的地方，洁净室或净化车间面积较大，位置集中、噪声控制和振动控制要求严格的洁净室应采用集中式净化空调系统。
如果净化空调系统需要电加热，应选择管式电加热器，电加热器应布置在高效空气过滤器的迎风面，并应有消防安全措施。
鼓风机可根据净化空调系统的总送风量和总阻力值选择，中效和高效空气过滤器的阻力应按初始阻力的两倍计算。
净化工程中的净化空调系统除了直流系统和带值班风机的系统外，还应采取防倒措施，防止室外污染空气通过新风进口进入净化车间。
净化空调系统的设计应合理利用回风。当工艺中产生大量有害物质，局部处理达不到卫生要求，或对其他工艺有害时，不应使用回风。