大规模生产食用菌是一项系统工程，净化车间是有机工程的一部分。
一般来说，系统性的东西非常注重部分与前后的联系，这就涉及到食用菌生产中不同蘑菇种类的净化车间的不同设计要求，以及规格的提前考虑。现实中有很多单独建设净化车间的情况，这显然不符合系统工程的基本概念。也有一些人缺乏净化车间的建设设计理念，根本把净化车间做成大接种箱，达不到净化车间应有的效果。各种错误甚至造成巨大损害的例子并不少见，比如我们之前批准的AF公司是业内的负面典型。
作为系统工程的净化车间，应包含以下基本成分：
1.功能区块结构系统系统
2.过滤新风系统
3.冷却系统
4.消毒系统
5.衔接系统
6.物料交换系统
7.操作和准备系统
8.菌种配套系统
在不同类型的栽培方法下，组成会有所不同。当规模不同时，会有不同的结构配置，在不同的工作模式下会有所不同。事实上，食用菌生产用的净化车间应有生产工艺和工艺要求参与设计，才能取得既有保障又经济适用的效果。
由于使用的同步性和管道的共享性，系统2。系统3经常交叉，系统1和系统2需要准确的合作，这涉及到系统5和系统6.7.系统8在不同的菌种模式下也要有所不同。
净化车间不是什么新鲜事，所以基本部件没有技术创新，但在大规模半连续材料生产的应用中，必须有一些结构组合的适应性调整。
以上系统各有不同的功能和一些基本参数。作为从事设计和施工的单位，这些东西必须能够清楚地处理。作为用户，施工参数的细节不清楚，但原理和依据不清楚。
从我接触到的现有净化车间来看，早期的食用菌净化车间建设完全缺乏这些概念。完整的系统净化车间设计必须基于总体生产框架设计。你怎么理解这一点？我可以给你一个大致的路线图：
首先，确定栽培容器（瓶或袋）的规格。记住，一旦确定，就不容易改变。半途而废几乎相当于灾难。因为所有合理的配套设施都必须更换，否则所有的设计意图都会被打乱。
自然，接下来从操作机械到周转的框架.因此，架子将确定相应的协调规格。然后是锅的规格，以及由锅规格计算的净化车间功能区的面积功率。
所以，情况很简单，如果有计划分期投产，也是按照终计划设计的，不是随便大一点或者小一点。
在我国食用菌行业，按照这一套路设计施工的食用菌工厂企业并不多，维修并不少见，但作为生产瓶颈，净化车间不适合维修。
之所以出现这么多问题，是因为我国食用菌产业本身和食用菌净化车间的设计建设机构对相关概念相当模糊。有的企业在想到净化车间之前就无法生产，有的企业对一些半拉子技术人员的计划感到困惑，有的企业认为这是理所当然的。总之，在我国食用菌快速发展的过去30年里，这种基于高端产业的思维建立严重滞后。
我曾经和一些从事施工的单位沟通过，发现他们根本不知道如何设计（但这并不妨碍他们实际上做了很多设计），甚至一些子系统的关键结构也相当模糊，他们的施工结果经常存在“窜风”(即气流组织不细致，不能保证气流按理想路线流动)和漏气，导致实际使用效果不达标。
在各子系统的建设协调方面，目前还没有看到任何值得肯定的技术总结。一些所谓的专利主要与净化车间的建设无关，因此净化车间建设设计与食用菌产业相结合的道路仍有待探索。
造成这一原因的一部分是用户企业不知道提出相关要求。此外，另一部分问题在于设计施工机构的短视和利润追求。毕竟，如果一个高水平的食用菌生产技术人员参与设计，他需要付出一定的代价。同时，行业内没有权威的咨询机构提供相关的专业创业指导。用户与设计施工单位的接触无序。设计施工单位没有长远规划，没有积累专业服务知识储备的基本理念。